Fuji GFX 50S predstavlja bezogledalni fotoaparat srednjeg (medium) formata i opremljen je medium-format CMOS senzorom (tzv. Fujifilm G Format) od čak 51.4MP (vrlo sličnim onom kod Pentax 645Z), koji je 1.7x veći od full-frame senzora i čak 4x veći od APS-C, karakterističnog za X seriju. Ovakve dimenzije senzora znače da je i svaki piksel veći u odnosu na full-frame, što donosi jasnije teksture i pokazuje svoj puni potencijal pri hvatanju velikih površina, poput pejzaža ili npr. reprodukcije istorijskih dokumenata. Ovako snažan senzor uparen je sa X Processor Pro procesorom preuzetim od Fuji X-T2 i Fuji X-Pro2, i oni u paketu donose Full HD video sa 30 fps i stopom bitova od 36Mbps (nema 4K), brojne Film Simulation modove, kao i Color Chrome Effect opciju, koja reprodukuje fine tonove kod meta sa veoma jarkim, zasićenim bojama. Što se tiče ostalih karakteristika, GFX 50S se odlikuje AF sistemom sa detekcijom kontrasta koji poseduje 117 tačaka, pokretnim TFT LCD ekranom osetljivim na dodir, sa dijagonalom od 3.2" i rezolucijom od 2.360.000 tačaka, potom OLED elektronskim tražilom sa uvećanjem od 0.85x i rezolucijom od 3.690.000 tačaka (koje se po želji uklanja), zatim tu su dva mesta za SD UHS-II memorijske kartice, Wi-Fi, baterija pruža autonomiju od 400 snimaka (nova baterija - NP-T125), a sve je to zapakovano u zaptiveno telo izrađeno od legure magnezijuma, koje je teško svega 740g i otporno na prašinu i vremenske neprilike. Fuji GFX 50S može još da se pohvali i omalenim displejom na gornjoj platformi, sa dijagonalom od 1.28", koji je zadužen za prikaz trenutnih podešavanja sa kojima se radi. Povrh svega, ovaj MILC se lako povezuje sa računarom i omogućava rad direktno sa PC-ja (tzv. tethering). Fuji GFX 50S može da se kombinuje sa odgovarajućom dodatnom opremom koja je dostupna zasebno. Tu su battery grip Fuji VG-GFX1, adapter za tražilo Fuji EVF-TL1 (koji omogućava rad sa tražilom iz različitih uglova), H Mount Adapter G za kombinovanje sa devet Super EBC Fujinon HC objektiva, kao i View Camera Adapter G za kombinovanje sa starijim Fujinon objektivima, kao npr. CM Fujinon. Kada je reč o bajonetu i objektivima, GFX 50S se kombinuje sa G-mount objektivima, koji su specijalno dizajnirani za njega, i kao i sva tela srednjeg formata, odlikuje se obrnutim krop faktorom od 0.79x, tako da npr. objektiv raspona 63mm pruža ekvivalentan raspon od 50mm kad se montira na GFX 50S.